豆粕、菜粕等蛋白质原料在饲料加工中不仅发挥粘结作用，还可形成颗粒内部结构并维持结构强度。原料的蛋白质含量和溶解度及其吸水性的增加可提高颗粒饲料硬度和耐久性。湿热处理通常能提高蛋白质的溶解度，易被挤压加工成型，而重复的加热会降低蛋白质的溶解度和黏结性能。因此，对于同类型原料，具有更高的溶解度（蛋白质分散指数）有利于形成良好的产品质量。相比于鱼粉、肉骨粉等动物蛋白，植物蛋白一般具有更高的粘度和更好的组织化性能。如棉籽浓缩蛋白可以显著改善饲料膨化效果，小麦面筋蛋白会提高颗粒硬度并降低吸油能力。大豆蛋白可以改善颗粒耐久性，但其高吸水性、高粘度特性也显著增加膨化、制粒过程能耗，因而需要更多的调质水分含量使其充分发挥粘结特性并降低设备负载。乙醇梭菌蛋白和荚膜甲基球菌蛋白等新型单细胞蛋白原料替代鱼粉可以提高饲料的膨化效果。与大豆浓缩蛋白不同，鱼粉、荚膜甲基球菌蛋白等原料具备良好的水溶性和塑化性，可以减少饲料加工过程对调质水分含量的需求，进而降低生产成本。有研究表明蛋白原料制粒特性由高到低排序依次为乙醇梭菌蛋白、棉粕、豆粕、菜粕、DDGS。水溶性纤维成分具有一定的吸水膨胀及粘度特性，适量添加可以改善制粒饲料硬度及耐久性。但配方中过多的不溶性纤维会显著增加制粒过程能耗，造成饲料成型难度大，同时因发生美拉德反应而降低饲料养分利用率。另外，使用富含油脂的原料如全脂大豆替代脱脂豆粕或者加工过程中脂肪含量过高也会对颗粒成型效果及耐久性产生明显的负面影响。