棉籽粕粗蛋白质含量变化较大，从40%左右到50%以上，因此，有的产品高于豆粕，但含有游离棉酚等抗营养因子；蛋氨酸等含硫氨基酸含量较高，但赖氨酸和精氨酸含量低，棉籽粕氨基酸消化率比豆粕低。棉籽饼粕可与豆粕等其他饼粕组合使用，改善氨基酸组成。普通棉籽粕可替代30%~40%的豆粕，脱酚棉籽蛋白替代比例可达60%~80%。